생쥐와 인간 다운로드

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마우스와 인간의 연결성, 강도 및 역학 데이터를 결합한 최초의 Synaptic 생리학 데이터 집합에 대해 알아보자. 전사체 탐색기를 사용하면 연구원은 웹 브라우저에서 마우스와 인간을 위한 전사체 데이터 및 전사체 세포 유형을 시각화하고 분석할 수 있습니다. 새로운 기능은 정기적으로 릴리스됩니다. 현재, 연구원은 수 있습니다: 단세포 및 단핵 RNA-Seq 데이터의 일관된, 고품질 샘플링을 위해, 8개의 대조군 (4 개의 음극 및 4 개의 양성)이 각 증폭 세트 (8 개의 대조군 + 88 샘플)에 포함되었다. 대조군 스트립에는 세포가 없는 2개의 우물(외부 RNA 제어 컨소시엄에 대한 ERCC, 음성), 세포가 없는 2개의 웰 또는 ERCC(템플릿 제어를 위한 NTC라고 함), 네거티브), 타카라 SMART-Seq v4 키트에 제공된 10pg 대조군 RNA(마우스) 2개(대조군 RNA, 양성이라고 함) 및 마우스 전체 뇌 총 RNA 10pg(MouseWhole, Zyagen MR-201, 양성)의 10pg 또는 인간 범용 레퍼런스 토탈 RNA(UHR, Takara 63638)의 10pg를 가진 2개의 우물. 마우스 및 인간 데이터에 대한 컨트롤은 아래 링크를 통해 다운로드할 수 있으며 자세한 방법은 기술 백서에 설명되어 있습니다. 풍부한 해부학적 및 생리학적 증거는 포유류 망막에서 1차 시각 피질로 시각적 정보를 전달하는 뇌 영역인 등쪽 측삭 지네알 누암(dLGN)에서 적어도 3가지 유형의 주요 또는 릴레이 뉴런의 존재를 뒷받침한다. 이 데이터 세트는 다운로드할 수 있는 이 영역에서 세포의 상세한 전사 프로필을 제공합니다. 이 지역에서 유래된 세포는 전사 프로파일에 기초하여 종 간 대응을 평가하기 위해 3종(인간, 원숭이 및 마우스)에 걸쳐 비교되었다.

OR: 모든 5kb 인간 또는 마우스 업스트림 서열 또는 모든 10kb 인간 또는 마우스 업스트림 서열 전사는 전사 시작 부위(TSSs)라고 불리는 게놈 위치에서 시작되며, RNA를 생성하며, 주로 이들 TSS를 둘러싼 유전체 원소 및 전사 인자에 의해 조절된다. 이는 TSS가 RNA의 규제 및 생산을 포함하여 전사 이벤트와 관련된 다양한 데이터 소스를 통합하는 더 나은 단위일 수 있음을 나타냅니다. 그러나 여러 TSS 데이터 집합 및 프로모터 아틀라스를 사용할 수 있지만 알려진 모든 TSS를 통합하는 포괄적인 참조 집합은 부족합니다. 따라서, 우리는 FANTOM5, DBTSS, EPDnew 및 ENCODE와 같은 공개적으로 이용 가능한 TSS 주석 및 프로모터 자원을 수집하여 인간 및 마우스 게놈에 대한 TSSS(refTSS)의 참조 데이터 세트를 구성했습니다. 데이터 세트는 TSS 피크의 게놈 좌표, 유전자 주석, 품질 검사 결과 및 인간과 마우스 간의 보존으로 구성됩니다. 우리는 또한 refTSS (http://reftss.clst.riken.jp/)를 검색 할 수있는 웹 인터페이스를 개발했습니다. 사용자는 데이터 및 전사 조절 및 전사 제품에 대한 정보를 수집하고 통합하기 위한 리소스에 액세스할 수 있습니다.

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